CRuE-2022

Comptes-rendus des groupes de travail 2022

Réunion CRuE du 10 novembre 2022

Présents : Carine, François, Frédéric
FS_UI et transfert
Quelques bricoles à corriger.
Il faut y regarder [Carine & Fred]
SWASHES
Message (en février) d’un chinois qui signale deux anomalies
Suite à la relance, Olivier a dit qu’il allait regarder.
Les epsilons sont à améliorer (à rajouter dans la liste des tâches, et sur SourceSup parmi les tâches en attente avec la réponse d’Olivier).
Nouvelle version de SWASHES
Publication de la version 1.04.00 de SWASHES (dont version Windows)
Dépôt de la version 2 sur HAL validé.
Pas de réponse concrète de l’éditeur de l’article SWASHES. En attente.
Liste de citations FS et SWASHES
Frédéric va continuer à rajouter les citations connues.
Il faudra ensuite rajouter les nouvelles situations.
Vidéo FS ou SWASHES
Nous n’avons plus les codes d’accès de la chaine YouTube de FullSWOF.
On pourrait en créer une autre.
Des vidéos, en plus des images, pourraient améliorer notre communication pour FullSWOF et pour SWASHES.
A réfléchir collectivement.
Valorisation des logiciels par le CNRS
François a un contact à CNRS Innovation (Sébastien Lebbe).
François va voir avec lui pour faire une réunion commune, afin de voir comment mieux valoriser FS et SWASHES (pour début 2022).
Master EuroHPC
Le projet d’école d’été sur le calcul haute performance à Grenoble en 2023 (16-28 juillet) est toujours d’actualité.
Des partenaires industriels pour un hackaton.
Carine attend la prochaine réunion pour en savoir plus.
GDR Outils théoriques pour le climat
GDR porté par des physiciens (INP) — Freddy Bouchet
INSIS et math comme institut secondaire.
Approches scientifiques, bien sûr.
Se donne un rôle politique sur le climat.
Enseignement en licence sur l’environnement : coordonner ça au niveau national pour que les différentes approches soient confortées.
GDR MathGeoPhy
Réunion en octobre.
François et Carine y étaient.
Permet de revoir les collègues.
Articles
Article Coriolis
Le papier est soumis.
Dans quel journal ? A suivre : A mettre dans la liste des tâches.
Proceedings Sym’Hydro
Il est sorti !
Références erronées sur HAL
De nombreux doublons et anomalies.
Erratum de SWASHES avec fichier original.
A corriger.
Bourse de thèse à Tours – pour mémoire
Avalanche de suspensions colloïdales non cohésifs.
François co-encadre avec Boris et Mohammed Boussafir (PR en géosciences dans le labo de Laurence)
Des nouvelles la semaine prochaine.
HDR Fred
Projet à finaliser …
Prochaine réunion
En janvier.
Evento à faire.

Réunion CRuE du 1er septembre 2022

Présents : Carine, François, Frédéric, Marco
Stage de Maxime
Très bon stage.
Une suite en thèse dans 2 ans ?
FS_UI et transfert
Soutenance lundi 4 juillet : bien passé.
Quelques bricoles à corriger.
Il faut récupérer la dernière version, et les sources [Fait, à regarder – Carine & Fred].
Kinnell
Frédéric a reçu un nouveau mail de Kinnell en août.
Il va lui répondre un jour.
SWASHES
Message (en février) d’un chinois qui signale deux anomalies
Olivier a fait une réponse.
Pas de nouvelles.
Carine pense qu’Olivier a répondu à un autre mail, contenant d’autres questions.
Carine fait une relance à Olivier par mail et François relancera Olivier à l’occasion.
Nouvelle version de SWASHES
Fait-on un addendum publié dans une revue ?
On se contente du document déposé sur HAL.
A voir si l’on peut lier le document SWASHES sur HAL avec le complément.
A voir si l’on peut ajouter un lien depuis le site de l’éditeur de l’article SWASHES.
[Fait – en attente de validation de la v2 sur HAL et du retour de l’éditeur]
On va publier la version 1.04.00 de SWASHES [Fait le 2/9, ainsi que la version Windows]
Liste de citations FS et SWASHES
Frédéric a repris les citations que l’on conseille pour en savoir plus sur FullSWOF et SWASHES. Ca marche avec wordpress et le bibtex directement (extension Teachpress) !
Frédéric continue à rajouter les citations connues.
Il faudra ensuite rajouter les nouvelles situations.
Parallélisation FS2D
Marco n’a pas pu y regarder cet été. Ça prend du temps.
A l’ordre 1, ça va, mais à l’ordre 2, c’est plus compliqué à cause des cellules fantômes.
Il faudrait redimensionner les tableaux pour limiter les cas où des économies de mémoire ont été faites ?
Les conditions périodiques ne sont pas beaucoup plus simples à paralléliser.
Les noms des vecteurs ne facilitent pas le travail.
Marco va essayer de coder une version « de base ».
Master EuroHPC
Carine va s’impliquer dans une école d’été qui est proposée par Grenoble en 2023, si la candidature est retenue.
Seule Grenoble a proposé une école d’été parmi les pays participants.
GDR Outils théoriques pour le climat
GDR porté par des physiciens (INP) — Freddy Bouchet
INSIS et math comme institut secondaire.
Se complète assez bien avec l’ex-Egrin « MathGeophy ».
La première réunion a eu lieu.
François suit ça au niveau du CNRS.
Carine suit les échanges.
GDR MathGeoPhy
Réunion en octobre.
Financement pour des jeunes jusqu’au 9 septembre.
Articles
Article Coriolis
Le papier est soumis.
Dans quel journal ? A suivre…
Proceedings Sym’Hydro
Fin juin, les corrections avaient été soumises.
Pas de nouvelles.
Renvoyer un mail à l’éditeur ? [Fait, pas possible de voir les proofs corrigées ! Pb pour changer l’auteur correspondant, on espère arriver à récupérer les mails ! ]
Manip Amina
Nom harmonisé sous HAL : « Nouhou-Bako » vs « Nouhou Bako ».
Bourse de thèse à Tours – pour mémoire
Avalanche de suspensions colloïdales non cohésifs.
François co-encadre avec Boris et Mohammed Boussafir (PR en géosciences dans le labo de Laurence)
François a reçu un SMS. Des nouvelles la semaine prochaine
HDR Fred
Projet à finaliser pour le 15 septembre.
Prochaine réunion
Vers les vacances de la Toussaint. Carine lancera un Evento.

Réunion CRuE du 1er juillet 2022

Présents : Carine, François, Frédéric, Maxime, Marco
FS_UI et transfert
Réunions hebdomadaires.
Implémentation des choses demandées.
L’interface génère le fichier transfert.
Rapport rendu. Qq fautes à corriger
Soutenance lundi 4 juillet.
Visualisation des résultats et paramètres hydro : pas implémenté.
Voir pour récupérer la dernière version, et les sources.
Bons étudiants, très autonomes.
Kinnell
Frédéric a reçu par Kinnell l’annonce du dernier article.
Il va lui répondre sous peu
SWASHES
Message (en février) d’un chinois qui signale deux anomalies
Olivier a fait une réponse.
Pas de nouvelles.
Carine pense qu’Olivier a répondu à un autre mail, contenant d’autres questions.
François demande à Olivier à l’occasion.
Stage Maxime (INSA Rennes)
Convention de stage et convention de cession des droits pour le code signées.
Stage du 7 juin au 28 juillet (dernière semaine en télétravail)
Mi-stage actuellement
Appropriation des outils (C++, cygwin, gnuplot, SVN, LaTeX)
A bien pris en main le logiciel
2 premières solutions statiques implémentées :
– barrage avec section parabolique en forme de « vrai » barrage
– barrage en forme de croix
Carine a fait tourné FS dessus. Quelques soucis avec le barrage parabolique.
Le barrage en croix fonctionne mieux. Il n’y a plus d’eau au temps final. A voir pour un temps intermédiaire.
Maxime a commencé à implémenter la géométrie sphérique (Williamson et al, 1997). 2 solutions terminées (pour la Terre) : Coriolis avec axe de rotation sur l’axe du repère polaire. Et avec axes décalés.
Autres solutions sphériques ?
Maxime a débuté la rédaction du rapport en français pour pouvoir le faire en anglais ensuite.
Article de Cosolino et al. (2015) : ouverture d’un barrage avec une vanne. Plus difficile à comprendre. Formules non incluses. Les fonctions de h(t) et v(t) ne sont pas incluses. Il y a deux pb de Riemann à résoudre (à droite et à gauche de la porte). A poursuivre. François va regarder l’article et a transmis un cours d’une collègue. Les questions sont du niveau M2.
Note : François Bouchut avait travaillé sur SW sur une sphère.
Liste de citations FS et SWASHES
Frédéric a repris les citations que l’on conseille pour en savoir plus sur FullSWOF et SWASHES. Ca marche !
Frédéric doit continuer avec les autres citations.
Thèse Noémie
Soutenance
Soutenance bien passée le 16 juin à 10h30.
Documentations de soutenance déposés à l’école doctorale.
Modifications mineures à faire au manuscrit (Président à indiquer sur la page de couverture, un mot à corriger, affiliation d’Emmanuel Audusse)
Article Coriolis
Noémie a discuté avec les co-auteur après sa soutenance.
Parallélisation FS2D
Marco était sur d’autres choses le mois dernier.
Master EuroHPC
Il y a un an, Marco avait été contacté pour faire partie d’un projet Master EuroHPC.
Porté par Sorbonne en France. Orléans un petit partenaire français.
Le projet a été accepté.
Financement pour 4 ans.
Les cours seront tous faits à Sorbonne.
Orléans peut intervenir sur des workshops, des stages et une école d’été.
Carine va s’impliquer dans une école d’été qui est proposée par Grenoble en 2023, si la candidature est retenue.
Marco n’avait pas été recontacté.
GDR Outils théoriques pour le climat
Nouveau GDR. Porté par des physiciens (INP)
François a un pied dedans.
Carine suit les échanges.
Articles
Manip Amina
L’embargo automatique sur HAL va sauter le 3 juillet.
Dans Hal : Nom à harmoniser : « Nouhou-Bako » vs « Nouhou Bako ».
Carine voit ça. En usurpant le nom d’Amina ? 😉
Bourse de thèse à Tours – pour mémoire
Avalanche de suspensions colloïdales non cohésifs.
François co-encadre avec Boris et Mohammed Boussafir (PR en géosciences dans le labo de Laurence)
Pas de nouvelles pour l’instant. Ils en seraient sur le réglage expérimental.
Toujours pas de nouvelles.
HDR Fred
Projet à finaliser pour fin été.

Réunion CRuE du 8 juin 2022

Présents : Carine, Frédéric, Maxime, Noémie
FS_UI et transfert
Les étudiants qui ont commencés fin avril termineront début juillet (soutenance le 4 juillet).
Ca a bien avancé, et ça prend forme.
Carine doit vérifier que les dépendances entre paramètres ont été bien implémentées.
Réunion vendredi
Comment de Kinnell
Suite à son dernier message, Frédéric n’a pas eu de nouvelles.
Pas de nouvelle, bonne nouvelle !
SWASHES
Stagiaire INSA Rennes
Convention de stage signée.
Convention de cession des droits pour le code signée.
7 juin –> 28 juillet (dernière semaine en télétravail)
Travail : inclure de nouvelles solutions dans SWASHES.
Maxime, arrivé hier, a commencé à lire l’article de SWASHES.
Installation de l’environnement pour codé en C++. A écrit et compilé « Hello World ».
A regardé la structure du code SWASHES.
Solution travaillée par Estelle MaisonHaute : comment faire une crète à hauteur constante ?
Message (en février) d’un chinois qui signale deux anomalies
Olivier a fait une réponse.
Pas de nouvelles.
Carine pense qu’Olivier a répondu à un autre mail, contenant d’autres questions.
Peut-être que François peut tirer ça au clair ?
Liste de citations FS et SWASHES
Frédéric a repris les citations que l’on conseille pour en savoir plus sur FullSWOF et SWASHES. Ca marche !
Frédéric doit continuer avec les autres citations.
Thèse Noémie
Soutenance
Soutenance autorisée, le 16 juin à 10h30.
Oral à préparer. Blanc de l’oral à planifier.
Article Coriolis
Selon Virgile, c’est presque prêt à publier.
Noémie compte en discuter à l’issue de sa soutenance.
Parallélisation FS2D
Marco était sur d’autres choses le mois dernier.
Articles
Manip Amina
L’embargo automatique sur HAL devrait sauter début juillet.
Projet Région RHÉFLEXES – pour mémoire
Argent dépensé.
Projet virtuellement terminé (officiellement fin 2022)
Bourse de thèse à Tours – pour mémoire
Avalanche de suspensions colloïdales non cohésifs.
François co-encadre avec Boris et Mohammed Boussafir (PR en géosciences dans le labo de Laurence)
Pas de nouvelles pour l’instant. Ils en seraient sur le réglage expérimental
HDR Fred
Projet à finaliser pour fin juin.

Réunion CRuE du 28 avril 2022

Présents : Carine, François, Frédéric, Marco, Noémie
FS_UI et transfert
Remise à jour de l’interface en prenant en compte le transfert de la version FS1D 2.0
Comment faire communiquer la partie Transfert et la partie SW ?
2 interfaces graphiques ?
Plutôt 1 seule. Avec un bouton radio dans les préférences : FS2D (seul) ; FS1D seul ; Transfert seul ; FS1D et Transfert ?
Les 2 étudiants sont partis sur la conception de la partie Transfer seule pour l’instant.
A voir quel travail est nécessaire pour convertir la partie SW (FS_UI actuel) dans le nouveau format.
Ajouter aussi la visualisation.
Carine a rendez-vous avec eux demain.
Comment de Kinnell
– réponse par mail ?
Frédéric va lui répondre par mail :
* merci pour suggérer ce processus.
* dans notre manip, les particules ne bougent pas si elles sont au fond.
– reply-to-comment ?
Pas pour l’instant
SWASHES
Stagiaire INSA Rennes
Maxime. 3ème année. Originaire d’Orléans.
7 juin –> 28 juillet (dernière semaine en télétravail)
Convention signée.
Travail : nouvelles solutions dans SWASHES
A voir lesquelles (facilité, diversité) — Carine et Frédéric
Certaines solutions sont assez différentes : coordonnées cylindriques, sphériques. On y regarde ? Oui.

Propriété du code : faire signer une convention de cession à Maxime et à l’UFR.
Carine repart de la convention de Noémie.
Message (en février) d’un chinois qui signale deux anomalies
Carine a préparé une réponse.
Olivier devrait regarder et répondre.
On attend des nouvelles d’Olivier.
François en discute avec lui dans 2 semaines.
Liste de citations FS et SWASHES
Carine a joué avec sa page web : la biblio se fait automatiquement à partir du BibTeX (grâce au greffon TeachPress de WordPress).
Il faudra rentrer un fichier .bib sur le serveur, et mettre des tags (SWASHES ou FullSWOF).
On peut ensuite faire une liste ou un appel à références.
Frédéric fera un fichier .bib puis le convertira en un pour les références SWASHES seules, un pour les références FullSWOF seules et pour les références communes.
Carine mettra ensuite ça sur le site.
Thèse Noémie
Soutenance
Manuscrit déposé, jury convoqué !
Soutenance prévue le 16 juin à 10h30.
Article Coriolis
Virgile compare les schémas à Godunov 2nd ordre.
Yohan et Manu y regarde.
Parallélisation FS2D
Marco est sur d’autres choses pour l’instant.
Articles
Manip Amina
Référence complète (numéro de volume).
L’embargo automatique sur HAL va bientôt sauter.
Projet Région RHÉFLEXES
Argent dépensé.
Projet virtuellement terminé (officiellement fin 2022)
Bourse de thèse à Tours.
Avalanche de suspensions colloïdales non cohésifs.
François co-encadre avec Boris et Mohammed Boussafir (PR en géosciences dans le labo de Laurence) Pas de nouvelles pour l’instant. Ils en seraient sur le réglage expérimental
Thèse de Meyssa
Soutenue (un peu compliqué techniquement).
Jean de Dieu pourrait recruter Meyssa.
HDR Fred
Projet à moitié terminé. Il vise le mois de juin pour le manuscrit.

Réunion CRuE du 10 mars 2022

Présents : Carine, François, Frédéric, Marco, Noémie
Stagiaire INSA Rennes
Maxime. 3ème année. Originaire d’Orléans.
7 juin –> 22 juillet … Fermeture du labo … Retour fin août ? télétravail ? < 2 mois
A voir pour la convention.
SWASHES : nouvelles solutions.
A voir lesquelles (facilité, diversité).
Visio à 15h ce jour.
Parallélisation FS2D
Marco a envoyé l’adresse du dépôt PLMlab pour le code parallélisé HPC.
Il a réussi à le compiler et à faire tourner leurs benchmarks.
Le code est difficillement lisible.
Il faut du temps dessus.
Marco y regarde quand il a un peu de temps
Projet de Master Euro-HPC
Marco n’a toujours pas eu de nouvelles.
Thèse Noémie
Coriolis
Noémie a relancé mais n’a pas eu de nouvelles pour l’article.
Virgile a soutenu et est en train de le reprendre.
Noémie a presque fini les corrections sur le chapitre. Elle doit le renvoyer à Carine.
FS vs expérience
Carine l’a fait tourner.
Avec la sortie expérimentale (bosse) : ne change rien sans frottement. Rapport de 1 pour 9 entre les vitesses extrèmes pour bien coller aux expériences.
Avec le frottement, ça creuse un peu plus la courbe du dépôt. Il faut un rapport de 1 sur 5 entre les vitesses pour que ce soit mieux représenté.
Code ajouté à FS1D par Carine pour avoir le débit en sédiments dans le domaine. Non publié. Faire une branche.
Modèle bicouche – Énergie
Soucis de définition dans Reynolds.
Calculs refaits.

Soutenance au plus tard fin juin, et donc manuscrit à envoyer fin avril.
Donc, pas le temps de faire tout ça.
On laisse donc ça de coté.
On va se contenter d’écrire que le modèle d’Enrique est améliorable et de mettre les résultats du début de thèse sur le modèle de Enrique.
FS
Prix du logiciel pour la science ouverte
On n’a pas eu le prix, ni de retour.
Demande de Kinnell de retirer l’article
Longs échanges de courriels avec Frédéric.
Kinnell semble calmer.
Liste de citations
Carine a regardeé à nouveau la biblio automatique sur le site du labo à partir de BibTeX (greffon TeachPress de WordPress).
Peut être numéroté ou pas, classé par année, etc.
A voir pour finaliser ça avec Romain (sans polluer le site du labo).
SWASHES
Liste de citations
Idem FS.
Prix du logiciel pour la science ouverte
On n’a pas eu le prix, ni de retour.
Message d’un chinois qui signale deux anomalies
Carine a préparé une réponse.
Olivier va regarder et répondre
Articles
Manip Amina
En ligne. Mais sans numéro de volume (early view).
Projet Région RHÉFLEXES
Projet prolongé jusqu’à fin 2022.
(permettra de dépenser ce qu’il reste, en particulier pour du matériel expérimental)
Bourse de thèse à Tours.
Avalanche de suspensions colloïdales non cohésifs.
François co-encadre avec Boris et Mohammed Boussafir (PR en géosciences dans le labo de Laurence)
HDR Fred
Finit un projet de synthèse biblio et s’y remet.